تنشهای زیستی و غیرزیستی از مهمترین عوامل محدودکننده عملکرد گیاهان زراعی مانند جوهستند. عوامل رونویسی در تنظیم ژنهای پاسخ دهنده به این تنشها دخالت دارند که خانواده ژنی WRKY رمز کننده گروه بزرگی از آنهاست. بنابراین شناسایی و مطالعه این خانواده ژنی میتواند گامی موثر برای ایجاد تحمل به تنشها در گیاهان باشد. در پژوهش حاضر، دانستنیهای مربوط به اعضای خانواده WRKY جو از پایگاههای داده جمع آوری شدند. با انتخاب یک عضو از هر زیر گروه ژنهای WRKY در برنج، tBLASTN در پایگاه دادههای IBSCو NCBI انجام شد تا اعضای احتمالی دیگر این خانواده نیز اضافه شدند. بر اساس مدل مخفی مارکوف، جستجو برای توالیهای دارای منطقه حفاظت شده WRKY علیه همه پروتئینهای این خانواده و هر زیر گروه آنها انجام شد. اعضای پیدا شده که شامل 96 عضوو یک توالی از هر زیرگروه عوامل رونویسی WRKY از گیاهان آرابیدوپسیس، برنج و گندم بودند، به صورت چندگانه هم ردیف شده و درخت فیلوژنتیک آنها رسم شد. توالیهای موجود بر مبنای تعداد پهنههای WRKY و ساختار انگشت روی موجود در سه گروه دستهبندی شدند. بر این اساس ۱۳پروتئین در گروه I،3۰ پروتئین با ساختار انگشت روی Cx7Cx23HxC در گروه III و بقیه پروتئینها با ساختار انگشت روی Cx4-5Cx22-23HxH در گروه II قرار گرفتند. با توجه به نقش گروه IIIدر تحمل گیاه به تنشهای زیستی و غیر زیستی، فزونی درصد حضور اعضای این گروه در جو همانند گندم نسبت به میانگین گیاهان عالی را میتوان با مضاعف شدگی دراجداد وحشی تک لپه ای ها و انتخاب طبیعی برای ارقام مقاومتر در شرایط نامساعد محیطی در ارتباط دانست.
Yazdani B, Asghari-Zakaria R, Shobbar Z. Identification and classification of the WRKY transcription factors family in barley. Genetic Engineering and Biosafety Journal 2015; 4 (1) :41-54 URL: http://gebsj.ir/article-1-81-fa.html
یزدانی بنیامین، اصغری زکریا رسول، شبر زهرا سادات. شناسایی و گروه بندی خانواده عوامل رونویسی WRKY در جو. مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی. 1394; 4 (1) :41-54