مطالعه in silico خانواده ژنی پلیآمین اکسیداز (PAO) در انگور
|
امین عابدی ، محمد مهدی سوهانی* ، رضا شیرزادیان خرم آباد |
گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران ، msohani@guilan.ac.ir |
|
چکیده: (6640 مشاهده) |
پلی آمین اکسیدازها (PAO) آنزیمهای وابسته به فلاوین آدنین دینوکلئوتید هستند که در کاتابولیسم پلیآمینها در پراکسی زوم، آپوپلاست و سیتوپلاسم نقش دارند. گزارشهای زیادی در زمینه اهمیت ژنهای PAO گیاهان در پاسخ به تنشها ارائه شده است با این حال مطالعه جامعی در مورد تعداد، روابط تکاملی، ساختار ژنی و الگوی بیانی ژنهای PAO در انگور موجود نیست. در مطالعه حاضر با استفاده از روشهای بیوانفورماتیکی، هشت ژن محتمل PAO (VvPAO1-VvPAO8) در ژنوم انگور 12X شناسایی شد. بر اساس مطالعه فیلوژنتیکی ژنهای VvPAO به سه گروه تقسیم میشوند که هر گروه از نظر جایگاه سلولی و کارکرد اختصاصی است. ژنهای VvPAO دارای صفر تا 9 اینترون میباشند و بر روی 6 کروموزوم از 19 کروموزوم انگور قرار گرفته اند. وجود چندین عنصر تنظیمی cis پاسخ به تنشها و هورمونها در پیشبر این ژنها دلالت بر نقش احتمالی آنها در پاسخ به تنشها دارد. بررسی داده های ریزآرایه ژنهای اورتولوگ PAO انگور در آرابیدوپسیس در شرایط تنشهای غیر زیستی نشان داد که سطح رونویسی این ژنها در پاسخ به تنشهای غیر زیستی افزایش مییابد که نشان دهنده نقش این ژنها در پاسخ انگور به تنشها است. نتایج این مطالعه دادهای پایه برای پژوهشهای بیشتر در مورد نقش ژنهای PAO در انگور را فراهم میسازد.
|
|
واژههای کلیدی: بررسی فیلوژنتیکی، بیان ژن، بیوانفورماتیک، پلی آمین، تنش غیر زیستی |
|
متن کامل [PDF 423 kb]
(3212 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
تخصصی متفرقه دریافت: 1395/10/24 | پذیرش: 1396/4/19 | انتشار: 1396/5/19
|
|
|
|
|
ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|