دانشجوی دکترای بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکده‌ی کشاورزی، دانشگاه شیراز، ایران
چکیده: (1627 مشاهده)
برای درک اکولوژی ویروس‌ها، لازم است تا اطلاعات جامع در خصوص برهمکنش‌های ویروس-ویروس و ویروس-میزبان در سیستم‌های طبیعی به‌دست آید. در این مطالعه، مشخص شده است که فناوری توالی‌یابی آر.ان.ای (RNA-Seq)، امکان این تحلیل را بدون مفروضات قبلی در خصوص آلودگی‌ها و علائم ویروسی یا ژن‌های میزبان فراهم می‌کند. توالی‌یابی نسل جدید امکان شناسایی بالقوه‌ی آلودگی‌های چندگانه را تسهیل می‌کند. پاسخ‌های ضد ویروسی میزبان به واسطه خاموشی آر.ان.اِ، تحت شرایط طبیعی اتفاق می‌افتد. از آنجایی‌که تحقیقات درزمینه ویروس‌های گیاهی به‌طور عمده بر بیماری‌های گیاهان زراعی متمرکز بوده‌اند، اطلاعات کمی در خصوص این ویروس‌ها در محیط‌های طبیعی وجود دارد. توالی‌یابی آر.ان.اِ در گیاهان مربوط به یک جمعیت طبیعی برای تعیین هم‌زمان حضور و عدم حضور همه‌ی ویروس‌هایی که توالی آن‌ها گزارش شده است، شناسایی ویروس‌های جدید و سنجش کمّی ترانسکریپتوم میزبان مورد استفاده قرار می‌گیرد. با معرفی معیارهای تعداد خوانش و پوشش ژنوم، آلودگی‌های ناشی از ویروس آشکار شده و برهمکنش‌های ذاتی و پنهان گیاه-ویروس می‌تواند کاربردهای مهمی در کنترل این عوامل بیماری‌زا داشته باشد.
Dehghanpour Farashah S, Salehzadeh M, Ashrafi A. New-Generation Sequencing and Intrinsic Virus-Virus and Virus-Plant Interactions. Journal of Biosafety 2019; 11 (4) :77-96 URL: http://journalofbiosafety.ir/article-1-389-fa.html
دهقانپور فراشاه سعیده، صالح زاده مهرداد، اشرفی احمد. توالی‌یابی نسل جدید و برهمکنش‌های ذاتی ویروس-ویروس و ویروس-گیاه. فصل‌نامه علمي ايمني زيستي. 1397; 11 (4) :77-96
